已知果蝇长翅和残翅、红眼和棕眼各为一对相对性状，分别受一对等位基因控制，且两对等位基因位于不同的染色体上。为了确定这两对相对性状的显隐性关系，以及控制它们的等位基因是位于常染色体上，还是位于X染色体上(表现为伴性遗传)，某同学让一只雌性长翅红眼果蝇与一雄性长翅棕眼果蝇杂交，发现F₁中表现型及其分离比为长翅红眼：长翅棕眼：残翅红眼：残翅棕眼=3：3：1：1。
回答下列问题:
（1）根据以上信息，能得出的结论是                                            。
（2）某同学分析上述信息，发现无法确定控制眼色的显隐性及相关基因到底是处于常染色体还是X染色体上。于是进一步进行实验：让F₁中的红眼果蝇自由交配，F₂中既有红眼也有棕眼，
则          眼是显性；对不同性别的果蝇眼色进一步统计：
如果                                        ，则控制红眼的基因位于    染色体上；
如果                                        ，则控制红眼的基因位于    染色体上。
（3）经研究证明控制翅型的基因位于常染色体上，且长翅由A基因控制，残翅由a基因控制。基因型原本为Aa的受精卵，因某种原因，导致染色体上的A基因缺失，也会导致个体最终发育成残翅果蝇。某同学将一只雌性长翅果蝇与一雄性残翅果蝇杂交，后代绝大多数为长翅，但出现了一只残翅雄果蝇。对此现象，该同学作出了三种假设：基因突变所致；染色体缺失所致；环境所致。为探究其原因，该同学将此残翅雄果蝇与一只正常发育的残翅果蝇杂交，后代全部在正常环境中培育：
若                                           ，则                           ；
若                                           ，则                           。
注：假设染色体上的A基因缺失不会降低配子的活性，也不会导致配子或受精卵死亡。