天然色素可赋予稻米多样化颜色。为解析红色稻米品种ka的遗传机制,研究人员以连续自交表型均稳定遗传的纯合品种ka(红色)、Dr(白色)和Pu(白色)开展实验(本题涉及的基因名称依次定义为A/a、B/b……)。
回答下列问题:
(1)ka和Dr正反交,获得籽粒( ),种植后自交获得籽粒( ), 自交获得 ,表型如下表,表明其遗传方式为母性影响(子代表型由母本的核基因控制)。完善表中表型数据。

(2)ka和Pu杂交,后代连续自交获得 的表型比例为9红:3棕:4白,表明ka中籽粒颜色由两对基因控制,结出棕色籽粒的 植株基因型为___________或___________。
(3)在定位好的A/a、B/b基因两侧设计PCR引物,引物对1和引物对2分别可扩增A/a、B/b全部序列。下图是对亲本ka、Dr、Pu和第(2)题中 某个体PCR后电泳的结果。已知图中①为ka,②为Dr,可判断a基因由A基因发生___________突变形成;③结出的籽粒颜色是___________或___________。

(4)回收第(3)题图中条带I和Ⅱ中的DNA,以speI(一种限制性内切核酸酶)处理,I中的DNA不能被切割,Ⅱ中的DNA被切割成4个片段,据此推测B基因突变为b基因的过程中至少有___________个碱基发生了突变。