在中国改革开放走进新世纪的历史性进程中，“顶层设计”也越来越多地被高层提及，频频出现在党和政府的重要文件中，这也预示着中国改革事业进入了新的阶段。
2010年10月，“顶层设计”在中共中央关于“十二五”规划的建议中首次出现。2012年12月31日，在中共中央政治局集体学习会上，习近平总书记指出，改革开放是前无古人的崭新事业，必须坚持正确的方法论，在不断实践探索中推进。要加强宏观思考和顶层设计，更加注重改革的系统性、整体性、协同性，同时也要继续鼓励大胆试验、大胆突破，不断把改革开放引向深入。2013年11月，党的十八届三中全会公报提出，改革开放的成功实践为全面深化改革提供了重要经验，必须长期坚持。坚持正确处理改革发展稳定关系，胆子要大、步子要稳，加强顶层设计和摸着石头过河相结合，整体推进和重点突破相促进，提高改革决策科学性，广泛凝聚共识，形成改革合力。为此，中央成立全面深化改革领导小组，负责改革总体设计、统筹协调、整体推进、督促落实。   
运用“探索世界与追求真理”的知识，说明深化改革要“加强顶层设计和摸着石头过河相结合”的合理性。